۲۱ اوت سال ۱۹۶۹ و دو سال پس از اشغال شهر قدس بهدست اسرائیل، مسجدالاقصی توسط صهیونیستها به آتش کشیده شد. در این آتشسوزی ۲۰۰ مترمربع از سقف مسجد بهطور کامل ویران شد، گنبد مسجد در پنج نقطه آن سوخت و یکی از آثار مسجد همراه با یک منبر قدیمی ارزشمند که ۸۰۰ سال سابقه داشت، طعمه حریق شد و از بین رفت.